《亚洲日本一区二区三区不卡不码》带来全新航海系统，玩家需要驾驶船只在广袤的大海上航行，这一创新系统为传统的CRPG游戏增加了全新的玩法。
航海系统包括了一个专门的大地图，玩家需要找到港口停泊，然后下船进入新的地图开始冒险。在港口，玩家可以招募船员、购买补给和升级船只。船员分为不同的种类，拥有各自的技能和特长，而补给的种类和数量会影响船员的斗志，并带来各种Buff或Debuff效果。
在海上航行过程中，玩家会遇到各种随机事件，包括海战。这些事件以文字冒险的形式呈现，玩家需要阅读文本，并在不同的选择分支间做出决策。事件的结果由船只和船员的等级、补给的数量以及玩家小队的能力等多方面因素决定，的策略性和趣味性。
由于场景切换时加载的内容过多，对硬盘性能较差的玩家来说会影响游戏体验。《亚洲日本一区二区三区不卡不码》游戏主线剧情和支线剧情之间存在一定的割裂感，整体剧情水准也不如前作。
